הצוות המקצועי של איגוד ערים לאיכות הסביבה – אגן בית נטופה מורכב מאנשי מקצוע מיומנים ובעלי ניסיון בתחומי איכות הסביבה, תכנון, פיקוח, חינוך סביבתי וניהול פרויקטים. הצוות פועל יום־יום בליווי הרשויות המקומיות, ביישום מדיניות האיגוד בשטח ובקידום פתרונות מעשיים לאתגרים סביבתיים, תוך הקפדה על סטנדרטים מקצועיים גבוהים, שירותיות ושיתוף פעולה הדוק עם כלל הגורמים הרלוונטיים.